梅雨期雨水多、雨量大，生姜易发生根腐病。发病初期，下部叶片的尖端及叶缘变黄，后蔓延至整个叶片，并逐渐向上部叶片发展，直至整株黄化萎蔫枯死。病株茎基部呈水浸状腐烂，刨根检查地下块茎褐变，根系不发达。该病与姜瘟的最大区别在于从茎基部外围开始发病，种姜未见肉色坏死、不腐烂、无臭味。
该病属真菌性病害（姜瘟是细菌性病害），以土传为主，姜块定植后温湿度变化大、遇连阴雨天气或水淹易发病，重茬、偏施氮肥、地势低洼、杂草多的田块发病重。
生姜根腐病属土传病害，发病后叶面喷雾效果差，宜采用拌土、灌根等方法施药。发病初期可用可杀得三千46.1%氢氧化铜水分散粒剂500～1000倍液或75%百菌清可湿性粉剂1000倍液对病株灌根，每株灌药液100～150毫升，每隔10天灌一次，连灌2次。可杀得三千46.1%氢氧化铜水分散粒剂为铜制剂，不可随意与农药、化肥混用，以防发生药害。
预防生姜根腐病应注意以下几点。（1）选用无病虫、无霉烂的种姜，播种时每100公斤种姜用50%多菌灵可湿性粉剂200克加水100公斤浸泡，4～5分钟后晾干待播。（2）发病严重的田块，在整地时每亩用70%甲基硫菌灵可湿性粉剂或50%多菌灵可湿性粉剂或50%敌磺钠可湿性粉剂1～1.5公斤，拌细土30公斤撒施。酸性土壤施石灰消毒，可预防土传病害。（3）与禾本科作物实行2年以上轮作。（4）生姜喜透气性好的土壤，可每亩基施腐熟土杂肥2500公斤、硼砂1公斤、硫酸锌1.5公斤，改良土壤。