随着养猪模式由一家一户饲养向养猪专业户、养猪场的转化，种猪繁殖障碍显得更为突出。种猪繁殖障碍因素很多，主要有遗传因素、环境因素、管理不当、疾病等。针对具体原因，应采取相应防治措施。
种公猪繁殖障碍
先天性不育 一般近亲繁育的个体常发生隐睾、睾丸发育不全和附睾发育不良，阴茎和包皮缺陷，精液品质不良，因此对这种公猪应及时淘汰。
后天性不育 1.性行为障碍。在交配时，公猪受到惊吓及其他恶性刺激均会引起性行为障碍。应改善公猪配种环境，减少不良刺激。2.性亏损。公母猪不分群或公猪交配次数过频，导致公猪性反射衰退，其表现是交配不射精、阴茎不能勃起或拒绝交配。为此，应将公母猪分圈隔离饲养。后备公猪不能利用过早，一般8月龄后才能配种使用，且每周配种次数不超过2次~3次；成年公猪以每周3次为宜，配种旺季可连续5次，休息1天。3.营养性不育。饲养水平影响公猪的发育以及初情期的来临。1岁以内的公猪营养不足，影响公猪个体的生长发育、睾丸的重量和精子的产生。而公猪肥胖也会造成不育。因此，营养不足的要提供营养平衡的全价日粮和清洁的饮水，夏季可喂青绿饲料，配种负担过重时应加喂动物蛋白料。过度肥胖的公猪要加强运动，适当减料。
疾病性不育 阴囊皮肤病、睾丸炎、附睾炎、包皮炎均会引起不育，一经发现应及时治疗。炎症引起的要局部涂消炎软膏，全身应用抗生素。对皮肤病如螨虫引起的要注射依维菌素，若治疗无效应及时淘汰。
热应激在各种环境因素中以高温对种公猪影响最大。使种公猪造精功能产生障碍的极限温度为30℃。为了消除高温环境的不利因素，尤其在夏季高温期间，可采取加强舍内通风、房顶喷洒井水、畜舍周围栽种树木、运动场上方搭置凉棚或建造葡萄架、种植葡萄或丝瓜等攀缘植物遮阴，力求使舍内温度不超过30℃。
母猪繁殖障碍
先天性不育 主要有子宫先天性畸形、卵巢发育不全、输卵管异常、雌雄间性等，先天性不育的母猪应及时淘汰。
母猪机能性不育 其中卵巢机能障碍较为多见。应从改善饲养管理着手，供给营养完全的饲料。对过肥的母猪适当减少精料喂量。
疾病性不育 其中以子宫内膜炎、阴道炎在生殖器官疾病中的比例最大。对子宫内膜炎的防治：首先从改善饲养管理着手，以提高母猪机体的抵抗力。治疗常采用冲洗子宫及注入药物的方法。冲洗的次数、间隔时间和冲洗液的容量，应根据炎症程度来决定。冲洗方法：先用生理盐水冲洗子宫，脓液排出后，再注入青霉素（20万单位溶于20毫升蒸馏水）或链霉素（1克溶于20毫升蒸馏水）。一般每Et或隔Et1次，3天~5天为一疗程。冲洗液所用量以回流液透明无异物为止，并尽量将冲洗液排尽。
胚胎早期死亡 一部分胚胎死亡是由于精液品质差造成的。衰老精子也会造成胚胎死亡。卵子衰老后，受精力大为降低。如果卵子在衰老期间受精，胚胎发育中途就极易死亡。因此掌握给母猪适期配种，选用精液活力强的种公猪配种，可有效地防止胚胎早期死亡。
流产 对流产的母猪要检查胎儿、胎膜及胎盘，确定有无畸形或病理变化，并取流产母猪血液、子宫分泌物、胎儿或胎儿的部分组织(胃、肝、脾、肾、肺和气管等)，进行病理学及微生物学检查，以查明病因，确定是否为传染性流产。在预防为主的方针下，对妊娠母猪必须根据其生理特点，改变饲养管理条件，特别是妊娠初期和末期，更要注意饲养管理，满足妊娠母猪的营养需要，防止外界冷、热、挤、撞、惊吓、驱赶、捕捉等不良刺激。妊娠母猪实行分圈饲养，精心管理以及适当运动等措施，可有效地减少流产的发生。
传染病 猪的布氏杆菌、钩端螺旋体病、弓形体病及猪瘟、猪乙型脑炎等都是引起母猪流产、死胎的传染病，应采取预防接种和隔离治疗。