苹果着色首先是苹果品种自身特性决定的，多受自身遗传基因控制。果面红色是叫花青苷的一类物质产生的，花青苷是果实成熟期，在果皮的下表皮细胞中生物合成的。苹果着色程度是由花青苷合成积累量的多少及分布状况所决定的。我们看到苹果果实有条红、纯红、鲜红、暗红及紫红等表现，是由于品种特性和栽培条件不同，花青苷在果实中合成分布规律及其它色素含量混合表现结果。
花青苷在表皮细胞中合成积累及分布规律除受品种特性制约外，多种环境因素和栽培措施也是影响其合成的必要条件。没有良好的外部条件，再好的苹果品种也不能生产出艳丽的红色果品。均衡的营养供给是花青苷合成的基础，果树施用适度的氮肥，充足的钾肥有利促进果实着色。而过量氮肥将影响果实着色不佳；光照是影响花青苷合成最重要的因子，光照通过果实中的光受体启动花青苷合成的基因和酶。照射紫外光的果实着色最佳，可见光只微弱着色，仅照射红外光则几乎不着色。因此，高海拔高纬度地区苹果着色好其原因就在于光照条件好；温度也是影响花青苷合成重要原因。首先温度要满足苹果树生长发育，开花结果的全过程，果实成熟期，一定范围持续低温、昼夜温差较大有利于花青苷的合成和积累；果实成熟期，土壤湿度只要满足果树正常生长，适当干旱能促进花青苷形成，如果水分胁迫妨碍果实发育，花青苷合成必然削弱。
苹果套袋技术是促进红富士苹果着色及提高外观品质的有效措施。苹果套袋促进果实着色机制首先是改变了果皮细胞内光受体的浓度，套袋对光敏色素含量有显著影响，从而提高了花青苷合成效率；二是套袋大大减少果皮中叶绿素含量，果实去袋后生成的花青苷在黄白果皮底色上表现得特别艳丽；三是套袋保持幼果在生长发育过程中免受风雨、烈日等不良环境因素的直接侵害，使果实表面细嫩洁净、果点稀小、果粉均匀。去袋着色后从光学角度自然也显得更加光洁鲜艳；四是套袋有效地防止食心虫、果锈、煤污病、轮纹病等病虫害对果实的浸染，同时又避免了农药对果实的直接污染。提高了果实外观品质，促进了果实着色，也是无公害绿色食品生产的有效技术。苹果套袋技术在推广过程中也出现过不少问题。实践表明，除了使用合格的果袋、科学地操作外，还必须与规范地栽培技术配套进行，才能达到优质果品生产的目标。