一、品种差异。在草莓主栽品种中，宝交早生、春香等多为正常完全花；而有些品种易出现雄蕊短、雌蕊长的花，且花粉粒少而小，多无发芽力，因而易发生畸形果。其防治对策为：配置适宜授粉品种。由于草莓存在着雌雄稔性的差异，故应选择宝交早生、春香等花粉量多的品种作授粉品种，与主栽品种混植。如山东省枣庄市山亭区大棚草莓，主栽品种为宝交早生，授粉品种为春香、丰香等，授粉品种比例占5-10%，能有效地降低畸形果率。
二、花朵级次。低级次花易出现雄性不稔，高级次花易出现雌性不稔，但前者只要有良好花粉就可正常坐果发育，而后者却不能坐果或坐果不良。一级序花一般正常果占90%以上，畸形果占5%左右，不坐果的很少；二级序花一般正常果占80-90%，畸形果占5-15%，不坐果的占5%左右；三级序花一般正常果仅占60-70%，畸形果和不坐果的各占15-20%。其主要防治措施为：疏除易出现雌性不稔的高级次花，可明显降低草莓畸形果率，且有利于集中养分，提高单果重及果实品质。
三、访花昆虫。草莓的访花昆虫主要有蜜蜂及花蝇、花虻类等。蜜蜂是草莓最重要的访花昆虫。调查结果表明，大棚草莓无蜜蜂及花蝇类区的畸形果率，比有蜜蜂及花蝇类的增加33%左右，高2倍以上。其主要防治措施为：①棚内放置蜂箱。保护地栽培的草莓花期早，前期自然出现的访花昆虫少，因此，最好在保护地内放置蜂箱，该法已被我国大棚草莓种植户广泛采用，效果很好。②采取人工授粉。在中午11-12时花药开裂高峰期，采取人工微风（用扇子等）进行人工辅助授粉，也有良好效果。
四、温度和湿度。低温、高温或高湿，都易引起畸形果的发生。草莓开花时，温度在0℃以下就可导致花托变黑；在40℃以上则花粉发育不良；高湿影响花药开裂，且引起水滴冲涮柱头。如枣庄市山亭区有的大棚草莓，在开花坐果期昼夜密闭，棚内形成高温高湿条件，3月上旬最高温度在35℃以上，相对湿度100%，棚内出现大量水滴，结果造成畸形果率高达80%。其主要防治措施为：花期应严格控制好保护地内的温度和湿度。温度宜控制在20-28℃，并适时放风以降温降湿。采用无滴薄膜，能防止水滴的影响。滴灌能有效地降低保护地内的空气湿度。花期只要地表不干，一般不需灌水。
五、花期喷药。草莓花期喷药易引起畸形果的发生，特别是当日开放的花朵更是如此。有的大棚草莓，由于花期滥用农药，不仅直接阻碍了授粉受精，而且杀死了蜜蜂及花蝇类，致使其畸形果率为正常用药棚的3倍左右。其主要防治措施为：减少用药次数。保护地草莓的病虫害防治应采用以农业防治为主的综合措施，尽量不用药或少用药。若病虫害较严重，则应注意在花前或花后用药。