近几年，为取得黄瓜的高产，在黄瓜病虫害防治上，主要依靠大量药剂，但农药用量和施用次数增加，反而增强了一些病虫害的抗药性，造成更大量的施用农药，也污染了环境。为达到既高产又能有效保护环境，需要在选育抗病品种基础上，采用以防为主的病虫害综合防治技术。
一、种子处理。用55℃温水浸种20-30分钟后，进行高温30-40℃保湿催芽。也可以用0.1%多菌灵盐酸盐+0.1%拜加溶液浸种1小时后洗净催芽，杀灭种子所带病菌。
二、土壤处理
1、苗床处理。苗床应选用无病虫土壤，育苗底肥应充分腐熟、捣碎。整地前应彻底清除各种作物病残落叶等残体。采用营养钵、营养方、营养盘育苗。对旧苗床，每亩可用70%土菌消可湿性粉剂和50%多菌灵可湿性粉剂各1.5-2千克/亩，拌细土20-40千克，均匀撒在苗床表面或盖种。也可播后用72.2%普力克液剂600-800倍液浇洒苗床。
2、栽培土壤处理。每亩用辛硫磷1千克和1千克来乐尔拌200千克细土，混合均匀，翻入土中，可防治地下害虫和根结线虫。
三、农业防治。定植前要深耕土地，精细整地，用充分腐熟的有机肥做底肥，适当增施磷肥和钾肥，避免连茬种植。灌溉要因地制宜，采用地膜覆盖、高垄栽培，用滴灌或膜下暗灌等浇水方式。前期适当控水促根，中后期顺水施肥，禁止大水漫灌。一般宜在上午或早晨浇水，浇水后需短时间闷棚提温。施肥应增磷钾肥，有利于增强植株抗病能力。锰肥可促进作物发育和延迟发病作用。硼肥能使幼苗增强对病菌的抵抗力。饼肥可对一些病原起拮抗作用。注重均衡施肥，防止氮肥过量。在黄瓜生长期间要及时把初发病叶片、果实或病株等及时摘除或拔去，以免病菌扩大蔓延。拔秧后，把残留的植株烧毁或深埋。
四、生态管理防病技术。对黄瓜的主要病害之一霜霉病采用控温调湿生态管理防病技术，即采用合理放风、浇水管理的方法，调控生态环境，控制病害，延缓病害发生时期，降低发病程度。大棚的具体管理方法为：日出前放风10-60分钟排除废气、湿气。上午闭棚3-5小时维持25-28℃，滴灌棚和地膜棚注意保持棚内湿度，避免高温灼烧。下午加大放风使棚温降至18-25℃，相对湿度60-70%，傍晚放风20-60分钟，外界平均气温高于12℃时整夜放风。阴天光照较弱时需全天放风，并注意防雨溅入棚室内。浇水宜在清晨和上午进行，浇水后需闷棚提温使棚温达32℃以上，维持1小时后放风，若2小时棚温降至25℃以下可再次提温，提温后需加大放风排湿。
五、化学防治。病害以防为主，从黄瓜1叶1心开始，每隔7-10天，应喷保护性杀菌剂1次，叶面、叶背及植株各部要均匀喷施，以晴天下午喷药为好，防治前要仔细摘除病叶、病果。
1、霜霉病：可用72%杜邦克露可湿性粉剂400倍液或72.2%普力克水剂防治。
2、细菌性角斑病：可用农用链霉素4000-5000倍液或30%DT杀菌剂500倍液防治。
3、灰霉病：可用1.5%甲霉灵粉尘剂喷粉防治，或用65%甲霉灵可湿性粉剂600倍液，或50%多菌灵可湿性粉剂800倍液喷雾防治。
4、炭疽病：可用5%加瑞农粉尘或50%多菌灵可湿性粉剂500倍液防治。
5、疫病：可用25%甲霉灵可湿性粉剂800倍液或64％杀毒矾500倍液防治。
6、瓜蚜、白粉虱：可用5%灭蚜粉尘1千克/亩喷药，或10%瓜蚜烟剂0.5千克/亩熏烟，或21%灭杀毙乳油3000倍液喷雾。