1、肥害。实际上是积盐的危害，主要原因是偏施化肥或过量施肥使土壤产生盐渍化。另外，施用未腐熟的有机肥，也是造成肥害的重要原因之一。发生肥害后，一是抑制蔬菜根系发育，削弱了对水、肥的吸收功能；二是土壤溶液浓度过大，蔬菜植株发生反渗透现象，导致生理萎蔫或叶缘枯焦；三是迸发有毒气体危害；四是引发蔬菜缺素症。
2、药害。有显著性药害，症状明显；有隐性药害，症状潜伏或者延至下茬蔬菜。产生药害的原因，一是选用农药品种不对路，或者误用了敏感性药剂甚至除草剂；二是施用浓度过大，误认为浓度高防治效果好；三是购买劣质农药；四是没有避开高温时节施药；五是没有避开开花时段施药。发生药害后，有的蔬菜叶片很快失绿；有的产生焦斑穿孔；有的落叶、落花、落果或者出现畸形；最严重的整株枯萎。
3、旱害。制约大棚蔬菜发展的最为关键因素之一。发生原因：一是蔬菜大棚选址不当，当地缺乏水源；二是有水源，但水质不良；三是水量充足，沟渠排灌设施不配套，有水难引，望水兴叹；四是棚室栽培容易呈现土壤表面潮湿、耕作层干旱缺水现象，造成不缺水假象而延误灌水。旱害既影响蔬菜适时播种出苗，又影响蔬菜正常生长，同时给蔬菜施肥、打药等管理带来较大的困难。旱害的影响有时超过肥害和药害。
4、连作障碍。就是在同一大棚中，年年或季季种植同一类蔬菜，而产量和产品质量会逐年下降。产生障碍的原因，一是同类或同种蔬菜偏爱某种营养元素，这类元素补充不及时，易出现缺素症；二是土壤病原菌的积累引发病害造成死苗，如枯萎病、黄萎病等；三是同一蔬菜根系分泌物质易导致土壤微生物菌落结构失去平衡，造成土壤老化。
二、防止措施
1、选好棚址，完善水系配套。确定大棚之前，要考察棚址是否有充足的水源，水源有没有被污染，有了充足的水源，一定要修好沟渠，便于引水、排水。有条件的地方每座大棚要装1个水龙头。标准的还应配设喷灌设备。同时在生产过程中勤于检查，防止真旱土表不旱的假象，而贻误灌溉时机。
2、平衡施肥，促进蔬菜稳健生长。一是要常年施用充分腐熟的有机农家肥；二是要施用精制有机肥；三是要改偏施氮肥为减氮、稳磷、增钾、配施微肥；四是要分次适量施肥。一旦出现肥害，要喷施多种活性微肥缓解肥害。
3、要科学用药，确保蔬菜安全。一是发生轻微的药害，可用加强肥水管理的办法，恢复蔬菜正常生育机能；二是要选准对路农药，注意蔬菜作物的敏感药剂，特别是除草剂施用要慎重；三是把握住农药施用的浓度比，同时避免重复使用一种农药；四是切忌随意混用农药；五是施药要避开高温；六是施药要避开蔬菜开花时间；七是施用过除草剂的器械，一定要清洗干净后再用。
4、轮作换茬，调整蔬菜栽培环境。一是番茄、茄子、瓜类易感病蔬菜，要分年或分季更换种植其它蔬菜品种；二是选用土壤重茬剂抑制病菌；三是针对缺素土壤及时补充所缺养分；四是发生连作障碍的大棚，首先要增施有机肥或种植绿肥改良土壤，其次要实行嫁接栽培（如茄果类、瓜类），再次是采用药剂消毒，如甲醛、溴甲烷等的土壤消毒。另外，可利用夏季高温对土壤进行消毒。可将深层土壤翻至土表，用200-250千克碎秸秆拌入5千克高温菌和3-4千克炭灰覆盖地表，再加盖农膜让阳光暴晒15-20天，可消灭病虫卵和土壤根结线虫。
