绿色果品生产过程中病虫害的发生是不可避免的，为使环境对果品均不造成污染，又保持农业生态系统的平衡和生物的多样化，要尽量减少化学农药的使用，采用综合防治的办法，达到生产无公害果品的目的。
一、农业防治法。培育和栽植抗病虫性强的品种和无病毒苗木，通过加强栽培管理措施，增强树势，提高树木抗病虫能力。注重病虫的越冬场所，清理枯枝、落叶、病虫、烂果、刮除老翘粗皮、集中销毁及树干涂白，消灭病虫源。秋末冬初，进行耕翻树盘，消灭土中越冬害虫，降低虫口密度。生长季通过地膜覆盖，果实套袋等，阻止幼虫出土危害和果实被害。
二、生物防治法
1、利用害虫天敌。首先是保护好自然天敌，减少广谱性杀虫杀菌剂的用量，或在天敌无活动期（如卵期、蛹期）用药；其次是人工饲养释放天敌，如赤眼蜂、七星瓢虫等；再是果园种植绿肥，招引天敌，如草蛉、瓢虫、小花蝽、螳螂等。
2、应用昆虫性外刺激。在果园挂性诱剂，如桃小食心虫、苹果卷叶蛾、梨小食心虫等性诱剂，诱捕大量成虫，减少雌雄虫的交配或干扰交配机率，使害虫繁殖数量减少，达到防治目的。
3、充分利用现代物理及高科技。如利用黑光灯、杀虫灯、诱虫灯、害虫测报灯等现代科技，可起到事半功倍的效果。
三、关键期用药
1、对症用药，科学用药。改革传统用药制度，不用高残留农药。
2、尽量少用有机化学农药，大力推广无公害农药。如施纳宁替代福美砷；松脂酸铜类（绿乳铜、博尔多乳油、氯氨铜）、波尔多液，药效长、效果好；生物源农药如农抗120、多氧菌素、多抗霉素、大生M-45、新灵、菌利灭、菌普克、取代多菌灵系列；阿维菌素、白僵菌、BT乳油、吡虫啉类等，可防治多种害虫、螨类、鞘翅目（蚧壳虫类）、双翅目（梨木虱）及鳞翅目（蛾类）、蚜虫类等害虫，杀虫效果好，又可保护天敌。
3、植物源农药。如茼蒿素、绿保威、绿树神医9281、除虫菊、松脂合剂、烟碱等，可起到驱避害虫。抑卵孵化、预防空气污染，防治小害虫等功效。
4、利用昆虫生长调节剂如除虫脲、杀蛉脲、灭幼脲、米满、扑虱灵等药剂，可调节昆虫的变态，抑制或加速幼虫脱皮，达到防治害虫的目的。
5、矿物源农药。如石硫合剂、索利把尔等具有杀虫的双效功能；柴油乳剂对蚧壳虫有特效；波尔多液类是防治多种病害的主要药剂，在避开幼果敏感期，减少果实药害及污染，是较好的保护性杀菌剂。
四、注重科学用药。绿色果品生产中对农药使用要遵循准确测报，选择对症农药，合理混配，交替使用，保护天敌的基本原则。选用高效、低毒、低残留、无三致（即致畸、致癌、致突变），对允许使用的化学农药，要采用最低有效浓度，不能盲目增加药量和防治次数，必须合理轮换用药。采取每个农药品种一年只用一次的方法，并且严格控制安全间隔期。
五、注意增效剂的使用和改进用药方法。如助杀、农药展着剂、害立平等增效剂，具有乳化、扩散、粘着防雨水冲刷等功能，配合农药的使用，可减少用药，提高药效，减少残留，杀虫迅速，降低成本，避免产生抗药性，延长药效期。同时根据害虫生物学特性，变喷雾为地下施、树干涂药环、烟雾等，都可减少污染，达到防治病虫的目的。
六、注重果实套袋。果实套袋可减少农药残留，避免化学农药与果面直接接触，提高果品的外观质量，是生产优质绿色果品的关键技术，应大力推广应用。