一、避免高温装箱
运输前，秧苗处于活力旺盛的生长阶段，在正常生长条件下，光合强度大，呼吸作用也旺盛，一旦离开正常的生长环境(断绝光、水、肥)，光合作用被阻断，但呼吸作用仍在进行，温度每升高10℃，秧苗体内的化学反应速度提高1～2倍。因此，为了减少秧苗的呼吸消耗，应尽量避免温室高温时装箱，防止将田间热带入箱内，加大秧苗的呼吸量而降低秧苗的质量。
二、喷秧苗保鲜剂
秧苗保鲜剂具有防病、减少水分蒸发和提高植物免疫等功能，在秧苗运贮前一天按规定的浓度喷施秧苗保鲜剂，保鲜效果显著。
三、增加箱内湿度
秧苗运输阶段，水分的供给减少，维持较高的空气湿度可以降低秧苗水分的蒸发强度，从而起到保鲜的效果。但是，湿度过高，特别是高温高湿有利于微生物活动，导致病害的发生与秧苗的腐烂。因此，运输时如果温度适宜或较适宜的温度偏低，可以通过装箱前浇水或喷水来增加运输期间的箱内小环境的空气湿度；如果外界气温很高而运输工具又无法控温，可以采用根部微环境的保水处理措施，如在根系水分较好时用保湿材料包裹根系等，以保持秧苗不萎蔫。此外，包装箱上应有通气孔，避免秧苗较长时间在湿润、缺氧条件下呼吸，素质下降。
四、尽量夜间运输
在炎热的夏季，昼夜温差较大，因此在夏季运输秧苗，要尽可能在夜间行车。另外，夜间运苗，一般路程次日上午即可到达，可争取时间及时定植，成活率高。
