有机肥料含有粪肥、绿肥、厩肥、堆肥等。这些肥料含有氮、磷、钾等多种无机盐类和蛋白质、脂肪和糖类等有机物质。肥效较好而持久，但施用后见效慢，所以又称为“迟效肥料”。有机肥料在水中会腐烂分解，消耗水中氧气，放出有毒气体(硫化氢、氨、二氧化碳等)对鱼类生长会带来一定的影响，施用时，不宜将大量新鲜的有机肥料直接施入鱼池，而应将其封闭发酵腐熟后再施为宜。
1、粪肥
包括人、畜、禽的粪尿等，是——种良效肥，含有较多的氮、磷、钾等肥分，同时含有一定量的钙、硫、铁等元素，宜作追肥使用。因粪尿中的氮素容易挥发，所以在使用前加盖保存，让其发酵后再用。施用时要因时因池制宜，要根据水的深浅、肥瘦和鱼的活动情况来决定用量，使用方法以少量多次的原则，可避免水质突然恶化。
2、厩肥
厩肥是家畜、家禽的粪尿和垫料的混合物，同样含有较丰富氮、磷、钾等。但垫料含纤维素多，分解较慢。农村中以粪坑把厩肥积存或堆积腐熟后使用，多作基肥也可作追肥。作基肥亩用量500公斤左右；作追肥时，可每隔7天左右施一次，用量约为基肥的十分之一二为宜。具体方法是将厩肥堆放在池塘一角，沉入水中，让其逐渐分解析出肥分，扩散到水中供鱼饵生物利用，效果良好。
3、绿肥
包括各种野生的无毒、分解快的草类、树叶、嫩枝以及各种栽培作物的茎叶，如三叶草、蚕豆(胡豆)、水花生、水葫芦等，都可以作养鱼的料。这些绿肥都易于采得，具有成本低，见效快的优点。它既可用作混合堆肥的原料，也可以直接沤刁：鱼池。一般先将草料扎捆，堆放于池边，用石块压于水底的方法，让其沤烂，析出肥分，达到培育浮游生物的目的。
4、堆肥
堆肥是指利用粪肥和草料混合沤制发酵而成的肥料。制作方法：准备充足的青草和畜、禽粪；分量各半。分层堆放于准备好的土坑或粪坑中，先放人一层青草，撒上少量(约1％上下)的生石灰，再放一层粪料，依此装料入坑，最后加水使料完全浸于水中即可，最后用稀泥密封坑口。约经半个月左右即可使用。使用时，揭开—部分封泥，取里肥汁泼洒鱼池。
二、无机肥料的种类和应用
无机肥料又称化学肥料。这类肥料的特点是含营养成分比较单纯，大多数是——种化肥仅含—二种肥分。施入水中易被分解，很快见效，因此又称其为“速效肥料”。包括有氮肥、磷肥、钾肥和钙肥等。
1、氮肥
氮肥能够直接被浮游植物吸收和利用，养殖业中常使用促进浮游植物的生长繁殖，提高滤食性鱼类和非鲫的饵料量。养鱼常用的氮肥有碳酸氢铵、硫酸铵、硝酸铵、氯化铵和尿素等。这些以铵态存在的氮肥，遇碱易变成气体挥发而降低肥效，因此不能和碱性肥料混合施用。氮肥也是速效肥，宜作追肥，也可作基肥。作基肥时，每亩可施1.5—2公斤，作追肥的用量为基肥的1／4--1／3。
2、磷肥
常用的磷肥有过磷酸钙和磷矿粉等。池塘中一般都缺乏磷，施用磷肥对促进浮游生物和水生生物的生长有明显作用。过磷酸钙是一种水溶性速效肥料，含有效磷16％一18％。磷矿粉则是由磷矿石粉碎而成，所含磷化合物主要是难于分解的氟磷灰石，磷的可利用性差，肥效也缓慢。使用过磷酸钙作追肥时，亩用量0.25公斤即可。同样不能与碱性肥料混合施用，否则会起化学作用，产生不溶性的磷酸三钙而降低肥效。
3、钾肥
常见的钾肥有氯化钾、硫酸钾、草木灰等，均能溶于水，一般情况下，池塘水体中的钾素较为充足，因此施钾肥的用量不需太多。作基肥亩用量大致为0.5公斤；作追肥施用量为基肥的1／4--1／3即可。草木灰含钾较多，碱性多，与其他肥料混合使用时不能勿略这一特性。使用草木灰时，最好先把灰润湿，然后均匀地撒在池塘中。还应指出的是，草木灰应保持干燥，如果遭雨淋后，其含钾量将会大量流失。通常钾肥与氮肥、磷肥一起混合施用，氮、磷、钾三种化肥在混合肥料中的比例以2:2:1为佳。
4、钙肥
常用的钙肥有生石灰、消石灰等。施钙肥有多方面的作用，既可以消毒，又可以中和酸性水体并提供水生生物所需要的钙素。其中最常用也是最适用的是生石灰，既方便又经济，可作清塘消毒剂，也可作基肥和追肥。
5、复合肥料
一般的指含有氮、磷、钾三种或其中两种要素而由化学方法加工制成的化学肥料。含有两种要素的叫二元复合肥料，如磷酸铵、硝酸钾等；含有三种的叫三元复合肥料，如硝磷酸钾等。此外，也含有三要素和某些其他元素的多元复合肥料。施复合肥可满足植物对多种养分的需要，其肥效优于其它化肥，并且贮藏、运输也比较方便。
三、施肥应注意的事项
施肥要做到有的放矢，应根据水体肥瘦合理施肥。一般瘦水塘和新建的池塘要施足基肥；肥水塘和淤泥较多的老鱼塘，可不施基肥。为了补充水体中的肥分消耗，促进饵料生物增殖，还需要对鱼塘追加肥料。追肥应掌握及时、均匀和量少次多的原则。
施肥的效量应随季节的变化而有所不同，一般是春秋两季少施(每次量可多些)，夏季多施(每次量宜少些)。平时还要根据天气、水色和鱼情的变化，适量施肥。通常是天气晴朗多施，阴雨天不施或少施，水色清淡多施，发现浮头或病害时不施。此外，为了充分发挥各种肥料的不同作用，在实际生产中，最好同时使用或交潜使用有机肥料和无机肥料，这样可以扬长补短。
当测知水体缺乏某些或某一种肥分时，则宜施以某种混合肥或单施针对补缺的化肥。总之，施肥要考虑到多方面的因素，往往在生产实践中要根据具体情况加以调整，才能取得良好效果。