有研究表明不同类型的实验室都存在微生物污染的问题。细菌、真菌和支原体等微生物由于随气溶胶扩散和实验人员操作不当等原因易导致实验室微生物污染，从而影响实验结果的科学性、准确性，高致病性的病原微生物还可能引起实验室工作人员的感染，甚至造成社会人群的感染，严重危害环境安全和公众健康。
目前，实验室微生物的污染情况普遍存在，主要是细菌、真菌和支原体等，极易引发生物安全事件。为了保证实验研究的准确性和科学性，保证实验室的生物安全，控制实验室微生物污染已经成为实验室重要的安全管理工作。
工作人员进入实验室必须穿灭过菌的工作服，再用75％乙醇擦拭手部、腕部，实验操作时动作轻柔，避免微生物气溶胶的产生。对于实验室的工作人员及日常养护人员采取培训、考核的制度，组织相关人员对生物安全管理进行交流及学习。根据需要增加实验室防护设备，如洗眼装置、消毒器具、生物安全柜等。
总之，控制实验室微生物污染的措施很多，单一方法必然具有局限性，效果不佳，尤其是细菌污染，细菌的细胞壁成分复杂，对消毒剂的敏感程度具有选择性，可以根据所操作的病原微生物进行灭菌验证。
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