近日，中国水产科学研究院黑龙江水产研究所淡水鱼类基因组学与基因编辑创新团队和盐碱水域养殖品种开发与利用创新团队联合攻关，由郑先虎、张颖研究员牵头，共同完成了鳇（Huso dauricus）全基因组测序与数据组装，绘制出国际上首个“鳇T2T染色体水平基因组图谱”。相关数据日前公开发布于美国国家生物技术信息中心基因组数据库（PRJNA1406371）。
鳇为鲟形目古老珍稀鱼类，素有“水中活化石”之称，主要栖息于黑龙江流域，是国家一级重点保护野生动物，兼具重要生态、经济与科研价值，受多重因素影响，野生种群资源持续衰退。为加强鳇种质资源的保护与可持续利用，黑龙江所开展了鳇全基因组图谱绘制，旨在为阐明其多倍化演化特征、解析重要经济性状遗传机制和开展分子育种工作奠定基础。
该研究综合运用PacBio测序、超长ONT测序、Hi-C染色体挂载及细胞分子遗传学技术，成功组装了鳇染色体水平高质量基因组。鳇基因组全长1.84Gb，N50为42.88 Mb，GC含量40.32%；共注释蛋白质编码基因60242个，基因平均长度12759 bp，平均外显子数量6.7个。共线性分析表明，鳇与小体鲟、匙吻鲟、中华鲟等物种间同源基因共线性关系高度保守，反映出鲟形目基因组结构的进化稳定性。细胞遗传学核型分析显示，纯种鳇染色体数目为168条，结合Hi-C染色体挂载结果及多倍体特征分析结果，判定鳇为六倍体物种。鳇旁系同源基因同义替换率（Ks）呈现典型的单峰分布，峰值位于0.03处，与四倍简并位点颠换率（4dtv）分布的峰值高度吻合，提示鳇可能仅经历一次近期全基因组复制事件。
该基因组图谱的成功绘制，将为开展鳇长寿、抗逆、高怀卵量等优质性状的遗传调控机制解析，以及鲟科物种演化规律与遗传实践研究提供本底数据基础，为鳇等鲟科鱼类的野生种质资源保护与利用提供重要支撑。
该项研究得到国家特色淡水鱼产业技术体系、国家淡水水产种质资源库项目、全国重要水产养殖种质资源精准鉴定专项、黑龙江省种业创新发展专项、中央级公益性科研院所基本科研业务费等项目资助。
日期：2026-05-09
