近日，中国热科院品资所在菠萝基因组研究领域取得了新进展，完成菠萝三个新材料的基因组测定和组装，发布了首个菠萝“端粒到端粒”参考基因组序列组装和“铂金级”菠萝基因结构注释信息，并搭建了菠萝基因组信息数据库。为菠萝分子辅助下的远缘杂交育种和高抗食赏两用新品种选育提供给了更为全面和扎实的基础。
菠萝作为全球第三大热带水果，因参考基因组序列缺失、不连续，存在较多的Gap，尤其是着丝粒/端粒附近等序列，以及相应基因结构注释不完善，极大程度限制了菠萝分子辅助育种和基因编辑定向育种的工作进展。研究团队选定了基因组未被解析的三个材料（BL、YLL 和 LY）进行 Pacbio HiFi, Nanopore, 和 HiC 建库测序、基因组组装和组装质量比较分析，选定一套最好的染色体集合，组成每条染色体都有完整着丝粒和端粒的组装集合。同时，对菠萝每一个基因进行人工查看、对照和校准，最终完成了菠萝高质量基因结构注释，BUSCO完成度从初始注释的 94.5% 提升到 99.2%。搭建了菠萝基因组信息数据库，该数据库提供当前可获取的所有菠萝基因组序列和注释信息。用户可以直接浏览查看这些资源，进行基因查找，序列比对，ID映射和转换以及数据下载等操作。此外，通过比较基因组分析和转录组数据联合分析，筛选鉴定了一个菠萝叶色调控基因。
相关研究成果以“The Pineapple Reference Genome: Telomere-to-Telomere Assembly, Manually Curated Annotation, and Comparative Analysis”为题发表于《Journal of Integrative Plant Biology》。冯筠庭副研究员、张伟博士、陈程杰副研究员为论文共同第一作者，中国热科院品资所栾爱萍副研究员和贺军虎研究员为论文共同通讯作者。该研究得到了国家自然科学基金、国家重点研发计划、中国热带农业科学院基本科研业务费专项资金、海南省自然科学基金的资助。
论文链接：https://doi.org/10.1111/jipb.13748。
日期：2024-08-20
马铃薯杂种优势遗传机理获破解
近日，中国农业科学院深圳农业基因组研究所经济作物全基因组设计育种创新团队与国内高校合作，发现显性与超显性杂种优势效应可以提高二倍体杂交马铃薯“优薯1号”的块茎产量与花粉育性，为马铃薯杂交育种提供了宝贵的遗传资源。相关研究成果发表在《自然·通讯（Nature Communications）》上。……（世界食品网-www.shijieshipin.com）
2024-10-30605
马铃薯单倍体诱导系创制成功
近日，中国农业科学院深圳农业基因组研究所黄三文团队创制了马铃薯单倍体诱导系，构建了利用双单倍体技术获得高纯度二倍体马铃薯自交系的方法，为二倍体马铃薯杂交育种提供了强有力的技术保障。……（世界食品网-www.shijieshipin.com）
2022-11-03857
吉林省农业科学院高油酸花生育种研究取得新进展
由吉林省农业科学院花生研究所花生种质资源研究团队、花生栽培与耕作研究团队，经人工杂交育种方法，连续多年的南繁北育，鉴定、筛选，选育出一批适宜我省种植的高油酸花生新品系。2022年6月，吉花25[GPD花生（2022）220087]、吉花26[GPD花生（2022）220088]两个花生新品种，通过了国家农业农村部非主要农作物登记，填补了我省高油酸花生品种的空白。……（世界食品网-www.shijieshipin.com）
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华南农业大学首次揭示植物一天中开花时间调控的分子机理，助力籼粳杂交育种
为了解决籼粳杂交制种产量低的问题，华南农业大学庄楚雄研究员/周海研究员团队从转录组中筛选到一个在水稻浆片中特异性表达的基因DFOT1（Diurnal Flower Opening Time 1）。……（世界食品网-www.shijieshipin.com）
2022-04-24886
四川农业大学动科院在调控鸡骨骼肌发育的分子机制研究中取得新进展
随着人们膳食结构的不断优化，对鸡肉的消费将保持长期稳定的增长态势。我国地方鸡因其肉质优于快大型肉鸡，更受消费者喜爱，具有更广的市场前景。然而，绝大多数地方鸡产肉性能不高，无法满足日益增长的市场需求。传统的家禽品种选育耗时长、花费大；杂交育种尽管可较快提高生产性能，但容易导致“高效”和“优质”失衡。因此，亟需通过现代分子育种技术培育新品种，在保持地方鸡优良肉质同时快速提高其产肉性能。……（世界食品网-www.shijieshipin.com）
2022-04-02812
中国农业科学院作科所专家倡导GS4.0作物杂交育种新方法
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2022-03-01958
南京农业大学农学院多倍体团队揭示玉米自交衰退的表观遗传调控机制
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2021-09-011065
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黄海水产研究所“一种生长快石斑鱼的人工杂交育种方法”获国家发明专利授权
近日，由中国水产科学研究院黄海水产研究所田永胜博士等研究发明的一种生长快石斑鱼的人工杂交育种方法获国家发明专利授权，专利
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